简单的说，二级域名:需要创建，设置DNS，修改A记录，指定IP等操作。可以说是独立的网站，对优化关键词排名比较有优势.
二级目录就是子目录，继承在主站目录下的，相当于网站的跟目录在建立一个文件夹存放网站。二级目录是属于主网站的，增加网站内容收录，权重方面不如二级域名。
二级域名和二级目录区别和优缺点：
1.二级域名用来优化的关键词的话，有优势。
2.二级目录当面临高难度的关键词时候，比起二级域名优势不明显。
3.二级目录的形式，多少会继承首页的权重，增加网站收录量。
4.二级域名，在搜索引擎看来是一个新的独立网站。网站权重、PR值之类的，要重头培养。
5.二级域名作为独立网站容易和其他网站做友情链接。
6.二级目录虽然比较难做友情链接，但也可以通过与对方网站做交叉连接得以解决
7.二级目录的使用会提高隶属站点的权重，因为蜘蛛在此站会做更多时间的停留，停留时间越长则权重越高，另外收录越多，权重越高。但是二级目录承载的内容有限。
什么时候使用二级目录？
做网站（尤其是中小型网站），可以靠多个二级目录来壮大网站。如果开设的二级域名太多，会削弱主站的优势。
所以我认为中小型网站（包括博客）尽可能使用二级目录的形式更好。前提是网站的内容和主站内容差不多。如果相差甚远，就应该考虑使用二级域名了。
什么时候使用二级域名？
大型门户网站、行业门户、垂直类门户等信息量巨大的网站，可以选择把信息量大的频道设置为二级域名。或者你的新开设的频道和主站不搭边，可以考虑二级域名。如果是地域型公司，也可以考虑按地区设置二级域名。
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